庆阳市疾控中心完成新冠病毒基因测序检测工作

作者：杨超月

9月10日，西峰区报告一例新冠病毒核酸初筛阳性人员，市疾控中心立即进行核酸检测复核，并连夜开展新冠病毒全基因组测序工作，经过连续36小时的奋战，于9月12日上午成功获得该病例新冠病毒全基因组序列。与甘肃省疾控中心测序结果进行比对，完全一致。

测序工作流程复杂，步骤繁琐，操作要求高，从RNA反转录、定量、文库构建到测序及数据分析，几十个操作步骤，都需要工作人员非常严谨地去对待，这也是对工作人员实验操作能力的考验。本次测序除西峰区1例病例外，还对镇原县疫情的9例进行测序。测序结果表明，该10例病例感染毒株均为奥密克戎（Omicron）变异株BA.2.76进化分支，与武汉参考株序列比对，测序样本覆盖度均达到99%以上。经省疾控中心与四川省疾控中心沟通，西峰区该病例序列与四川省内江市目前正流行的新冠病毒序列基因组同源性为100%。

此次测序的成功开展是我市首次将高通量测序技术运用到新冠疫情防控工作当中，为我市新冠肺炎疫情防控的精准溯源提供了坚实的技术支撑，标志着我市传染病防控分子溯源能力跻身全省前列。

新冠疫情发生以来，为精准有效处置疫情，实现传染病病原快速鉴定和溯源，市疾控中心在全省率先配备了高通量二代测序仪，组织骨干力量先后赴中国疾控中心病毒所学习，掌握了测序等相关专业技术，成功搭建起高通量测序(NGS)技术平台，确保在发生疫情时能第一时间启动测序工作，通过对基因序列的分析比对，判定病毒属于哪一种变异株的进化分支，从而更准确地追溯病毒的来源，对疫情研判分析和后续疫情精准防控工作起着重要作用。